Haig Balian is sinds 2003 werkzaam bij de Stichting Natura Artis Magistra van Artis, waarvan tot 2017 als directeur. Onder zijn leiding volgde Artis een nieuwe koers, waarbij het zich meer ging richten op de verbinding tussen mens en natuur. Balian voerde bij Artis veel vernieuwingen door. Zo zorgde hij voor minder, maar grotere dierenverblijven, werden rijksmonumenten gerestaureerd en kwam er meer aandacht voor planten, bomen en dierenwelzijn. Balian maakte Artis toegankelijker, met name voor scholieren, chronisch zieke kinderen, mensen met een laag inkomen en vluchtelingen. Ook nam hij in 2014 het initiatief voor het openbaar toegankelijke Artisplein.
Onder leiding van Balian zijn in Artis twee belangrijke musea geopend: Micropia in 2014 en het Groote Museum in 2022. Beide musea, die internationale erkenning en prijzen hebben ontvangen, laten de bezoeker op een interactieve manier zien hoe dier, plant, microbe en mens met elkaar samenhangen. Tot slot zorgde Balian voor een betere relatie met de wetenschap, bijvoorbeeld door de oprichting van een Artis-leerstoel aan de Universiteit van Amsterdam, en door de komst van een Micropia-professor, in samenwerking met de Vrije Universiteit.
Voor zijn bijzondere verdiensten en bijdragen aan de ontwikkeling van Artis is Haig Balian benoemd tot Officier in de Orde van Oranje-Nassau.